该剧主要讲述了环境资源法官罗远、法庭顾问夏未冬等一批锐意有为的司法工作者在一连串环保案件中扫黑除恶明法、打击污染犯罪、维护环境生态、探索司法改革、捍卫公众权益的故事。作为中国首部环保司法题材剧，剧集聚焦长江流域环境保护司法实践的精彩案例，讲述环境资源审判的“中国故事”。影片编创团队希望用这样一部故事背景源自生活、视角兼顾官方和民间的现实主义大剧，来吸引社会各界的关注，借此展示环保司法改革之路的艰辛，推广绿色发展理念，增强民众环保意识。
1948年，“五一口号”发表后，以童江南教授为代表的在香港的一批爱国民主人士，积极响应共产党的召唤，准备回到解放区。国民党反动派对此横加阻挠破坏，并派张幕等人意图控制教授等人，苏行曾经是童江南教授的学生，接到组织的任务，赴香港护送民主人士回解放区，在港与国民党反动派展开了一场生死较量。苏行刚到香港，敌人就杀害了负责联络童教授的大公报副主编涂哲，这给他的工作造成极大困难。为了尽快护送童教授等人回解放区，苏行从追查杀害涂哲的凶手入手，挖出了张幕的直接联络人党勋琦，发现了暗藏的敌人“蜜蜂”，阻止了张幕带童教授离港的计划，解救了被张幕绑架的童教授和他的女儿童笙。在驶往烟台的船上，彻底制服了企图炸船的张幕，成功的将童教授等民主人士安全护送回解放区。
在第二部里，包拯（陆毅 饰）已经褪去了初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，而成了稳重有担待的县城父母官，偏安一隅为民请命。这天收到皇上急召回京，查办收受贿赂贪污的官员接连连续死亡的案件。少年包青天再次出动，而沿路上在各个案件里遇见的王朝马汉、张龙赵虎，日后都会是我们熟悉的大名鼎鼎的包公身边的护卫人物。公孙策（任泉 饰）已然拜服在包拯的聪明才智下，甘愿辅佐他办案。这次遇见的姑娘的是惯偷小蜻蜓（范冰冰 饰），活泼捣蛋的她一直身份神秘，直到案件去到大画家冯止水事件，大家才明白小蜻蜓的身世悲惨：收养她的义父自小视他如己出，为她亲笔作画《牡丹亭上的少女》，内藏一秘密。后来失踪于江湖再无音信，多年来小蜻蜓用尽办法找寻义父下落皆无消息，这次唯有希望包拯能查出事情真相。
在结束了一段无疾而终的恋情后，善良而乐观的女青年唐印，辞去热爱的演艺工作，踏上了前往陌生岛屿的逐梦之旅，准备开展她的代购事业和新的人生，却被她昔日的闺蜜沈可可带进赌场丢了本钱。随后沈可可神秘失踪，正当唐印失落绝望时，她遇见了经营一家酒馆的美少年捡子，并险些酒后乱性，两人成了剪不断理还乱的欢喜冤家，开始了一场浪漫惊险、悲喜交加的冒险之旅，也因此深陷一场充斥着金钱、欲望甚至死亡的权力游戏。
现代人元明玉（陆妍淇 饰）穿越成为随时被刺杀的素叶国恶女四公主，只有成为女帝才能回到现代。性格火爆的御姐元明玉开启称帝之路，她撩拨身边的纯情隐卫叶韶（黑泽 饰），让他保护自己安全，却不料小隐卫也对她正有心意，俩人携手打破各种偏见与阻拦。元明玉认定叶韶是她在这个时空最值得信任的人，却不知一切都是假象，她最信任的小隐卫是前朝皇子，而接近她只是为了拿到象征兵权的鱼符。在皇权与爱情中，元明玉不做选择，她全都要，开启攻略之路。
少年黄飞鸿（释小龙 饰）自小聪颖正直，常和恶势力斗得头破血流。但作为一个孩子，他也有顽皮捣蛋的一面，每每闯了祸其母亲吴娴就帮他脱困，与黄飞鸿更似一对朋友，而黄飞鸿的父亲黄麒英（何中华 饰）则严肃古板得多。某日，黄麒英十三表叔的女儿十三姨（郝蕾 饰）从英国回来，寄居在黄麒英家里，受过西方教育的她热情奔放观念先进，很快融入黄家，唯独黄麒英对其过于新派的作风不以为意。谁知飞来横祸，吴娴葬身火海，黄家遭此突变，众人都难以接受。丧妻不久的黄麒英更是卷入一场杀人案，被疑为凶手。解救父亲并查明母亲被害事件的重任只得交由黄飞鸿和十三姨身上了……
